2021年11月22日，通过日本文部科学省的重重审查，九州大学正式被认定为【指定国立大学法人】。
至此，在日本一共86所国立大学中，成为指定国立大学法人的大学达到了10个，分别是东北大学、东京大学、京都大学、东京工业大学、名古屋大学、大阪大学、一桥大学、东京医科齿科大学、筑波大学、九州大学。其中大部分院校都是在日本国内有较大影响力的旧帝国大学。
指定国立大学（Designated National University），是日本政府为了进一步提高科研水平和改革创新能力，从2016年开始实施的科教政策。由日本文部科学省在日本国立大学中，评选出具有世界最高水平的教育科研能力的成员，最终确认为“指定国立大学法人”。评委会对“指定国立大学法人”的数量虽然没有做上线规定，但是其申报的指标非常严苛。评估指标包括研究、社会合作和国际协作等三大项。每个指标又下设若干单项。按规定，每项得分排名均需要达到日本国内大学前十。
未来，九州大学作为指定国立大学法人，将以“综合知识引领社会变革”为目标（総合知で社会変革を牽引する大学），强化治理及财务基盘的同时，以发挥本校“脱碳”、“医疗·健康”、“环境·食品”领域的优势解决全球性社会问题；以及通过数字化转型提升教育・研究・医疗水平为主要支柱，发挥综合性大学自然科学、人文社会科学、以及艺术工学等多学科体系创造新知，从福冈·九州面向日本、亚洲以及全世界，积极开展教育、研究、社会连携及国际合作，为实现可持续发展社会及人类福祉做出贡献。
指定国立大学法人在国际竞争中立于全球顶尖大学之林，承担着积极做出促进社会及经济发展的卓越贡献，推动日本国立大学改革的责任。此项新制度正逐渐打破 “7帝大”的传统格局，未来或将成为日本顶尖国立大学的新标杆！ 此外，成为指定国立大学之后，日本政府在科研经费等许多政策法规上会予以特殊支持。同时在管理运营、财政基础等方面也将享有更大的自主权。
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